محمدمهدی مهدی‌خانی مهاجم سابق شهرخودرو به  پرسپولیس  پیوست تا جانشین عیسی آل‌کثیر شود که تا شش ماه محروم است. وی در فصل اول حضورش در شهرخودرو نتوانست گلزنی کند اما نمایش قابل‌ قبولی را از خود به جای گذاشت.

با حضور یحیی گل‌محمدی در شهرخودرو، مهدی‌خانی فرصت بازی بیشتری را هم پیدا کرد. وی در لیگ هجدهم و جام حذفی، ۲۸ فرصت بازی پیدا کرد که ماحصل آن، ۳ گل برای شهر خودرویی‌ها بود.

پس از آن، مهدی‌خانی پیشنهاد تیم واراژدین کرواسی را پذیرفت تا خیلی زود در ۲۲ سالگی طعم لژیونر شدن را بچشد و شماره ۷۷ واراژدین را به تن کرد. او که در ۱۷ بازی برای واراژدین یک گل به ثمر رسانده، حالا به عنوان بازیکن لژیونر به پرسپول آمده تا دوباره شاگرد یحیی شود.

مهدی‌خانی در لیگ هفدهم فرصت حضور در ۱۲ مسابقه را به دست آورد. وی پیش از پیوستن به شهرخودرو، عضو تیم فوتبال زیر ۲۰ سال ایران بود و با درخشش در تیم مشهدی، به تیم فوتبال زیر ۲۳ سال ایران هم دعوت شد.