: بیشتر سقط‌هایی که در سه ماهه اول بارداری رخ می‌دهد، به دلیل ناهنجاری‌های کروموزومی در جنین است.
زمانی که سلول تخم تشکیل و تقسیم می‌شود، ممکن است اختلالاتی در تعداد یا در ساختمان کروموزوم به وجود آید که در این صورت حاملگی طبیعی نیست و بهتر این است که جنین در چنین وضع سقط شود. کروموزوم به ساختار بسیار ظریف و کوچک داخل سلول اطلاق می‌شود که ژن‌های زیادی را حمل می‌کند.
ژن‌ها تعیین‌کننده خصلت فیزیکی افراد نظیر جنس، رنگ مو، رنگ چشم و نوع گروه خونی است. بیشتر ناهنجاری‌های کروموزومی به طور اتفاقی رخ می‌دهد و ربطی به سلامت پدر و مادر ندارد.
معمولا ۶۰ درصد سقط‌ها این علت را دارد و نگرانی در مورد تکرار آن بی‌مورد است، ولی درصد کمی از سقط‌ها ممکن است علت زمینه‌ای داشته باشد که باعثتکرار سقط شده و باید از لحاظ مشکلات کروموزومی، مشکلات غدد داخلی و ایمونولوژی بررسی شود.
بعد از یک‌بار سقط جنین، نیاز است که تمام عوامل آن بررسی شود و معمولا بعد از یک‌بار سقط، به طور لزوم احتمال تکرار آن وجود ندارد. توصیه می‌شود بعد از سقط جنین در فاصله سه ماه، برای بارداری اقدام صورت بگیرد.
