در بیانیه‌ای که واتیکان صادر کرده، پاپ فرانسیس با تقاضای استعفای سه اسقف بلند پایه در کشور شیلی موافقت کرده است. پاپ همچنین مسئولینی را برای اداره موقت سه حوزه تحت امر اسقف‌های مذکور، گمارده است.
خوان باروس ۶۱ ساله از زمانی که پاپ در سال ۲۰۱۵ وی را به اسقفی ناحیه اوسورنو در شیلی انتخاب کرده بود، در کانون یک رسوایی بزرگ جنسی قرار داشت. باروس به سرپوش گذاشتن بر آزار جنسی کودکان توسط کشیشی به نام فرناندو کارادیما در دهه‌های ۸۰ و ۹۰ میلادی در شیلی متهم بود.
به نقل از آسوشیتدپرس، پاپ با پذیرش استعفای دو اسقف دیگر نشان داد که بار این رسوایی بزرگ در کلیسای شیلی تنها بر دوش باروس و یا بیش از ۴۰ کشیش و سه اسقف دیگر تعلیم یافته توسط فرناندو کارادیما نمی‌باشد.
کاردیما در سال ۲۰۱۱ میلادی توسط واتیکان گناهکار شناخته شده و به "توبه و طلب آمرزش مادام العمر برای جرایم جنسی" خود محکوم شده بود.
پاپ فرانسیس اولین رهبر کاتولیکی است که به وجود "فرهنگ سوءاستفاده و سرپوش گذاشتن" در کلیسای کاتولیک اذعان کرده است.
در سال ۲۰۱۵، بسیاری از سیاستمداران و رهبرای کلیساهای شیلی خواستار برکناری خوان باروس شدند، اما پاپ در قبال این خواست عمومی مقاومت کرده بود.
