عنان در سال ۲۰۱۸ نامزدی خود را برای انتخابات ریاست جمهوری مصر اعلام کرده بود.
عنان یکی از بارزترین اعضای شورای نظامی مصر بود که بعد از کناره گذاشته شدن حسنی مبارک رئیس جمهور پیشین مصر در ۱۱ فوریه سال ۲۰۱۱ میلادی قدرت را برعهده گرفت. یکسال و نیم بعد، محمد مرسی رئیس جمهور معزول مصر وی و حسین الطنطاوی را برکنار کرد.
