پرسپولیس تابستان سال ۱۳۹۱ برای شرکت در دوازدهمین دوره رقابت‌های لیگ برتر سراغ مانوئل ژوزه رفت و با این سرمربی پرتغالی قرارداد بست. مردی که در داخل کشورش از او به عنوان دشمن درجه یک کارلوس کیروش یاد می‌کنند!
مانوئل ژوزه ۱۳ مهر آن سال طی مصاحبه‌ای بلند بخشی از ماجراهای پشت پرده پرسپولیس و البته داستان خود با کیروش را بر زبان آورد که بد نیست به اتفاق هم آن‌ها را مرور کنیم:
حضور در پرسپولیس ریسک بسیار بزرگی بود چون فقط ۱۵ روز قبل از شروع لیگ هدایت این تیم را قبول کردم اما پشیمان نیستم چون در تیم پرطرفداری کار می‌کنم.
لوییس فیگو، دکو و نونو گومژ از جمله شاگردانم در فوتبال پرتغال بوده‌اند.
پرسپولیس برای این فصل ۱۷ بازیکن جدید جذب کرده که باید با یکدیگر هماهنگ شوند. ما برای ساختن این تیم زمان لازم داریم و نمی‌توانم معجزه کنم.
یحیی گل‌محمدی را خودم انتخاب کردم و از وجودش به عنوان دستیار استفاده می‌کنم. سعی کردم کسی را انتخاب کنم که به من خیانت نکند و امیدوارم چنین اتفاقی رخ ندهد (گل‌محمدی بعد از قطع همکاری باشگاه پرسپولیس با مانوئل ژوزه، در همان لیگ دوازدهم سرمربی پرسپولیس شد)
مشکلات پرسپولیس زیر سر کارلوس کیروش است. او علی کریمی را مقابل من گذاشت و باعث شد در تیم تنش ایجاد شود. کیروش یک آدم فوق‌العاده کینه‌ای است و از ناکامی پرسپولیس خوشحال می‌شود چون من هدایت این تیم را بر عهده دارم.
در واقع وقتی به ایران آمدم، می‌دانستم که بزرگترین مشکلم کارلوس کیروش خواهد بود. باور کنید حتی سفیر پرتغال در تهران قصد داشت ما را باهم آشتی بدهد اما قبول نکردم چون می‌دانم کیروش آدم خوبی نیست.
بعد از یورو ۲۰۰۴ این شانس را داشتم که هدایت تیم ملی پرتغال را بر عهده بگیرم ولی شرایط فراهم نشد.
